特种医学博士后科研流动站设立于2019年，设站单位是法医学院。现有博士后合作导师14人，已招收博士后2人。
特种医学由放射医学（核医学）、法医学和职业病学 3 个二级学科组成。放射医学（核医学）始建于1958年，是我国最早建立的核医学科之一，为山西省核医学发源地和教学、科研与临床指导中心。学科现为中华医学会核医学分会主任委员单位、全国住院医师规范化培训基地、国家药物临床试验机构、分子影像精准诊疗省部共建协同创新中心、国家创新型放射性药物及新药临床评价技术平台专项、山西省分子影像重点实验室、山西省1331工程重点科技创新团队，连续5年进入《中国医院专科声誉排行榜》优秀专科全国排名前十。学科团队先后承担国家创新型放射性药物及新药临床评价技术平台、国家自然科学基金重大项目、国家自然基金面上、青年项目和国际原子能结构、卫生部项目及省级重大、重点项目课题，承担重大仪器临床验证、新药临床试验近10项，申请获批专利40多项。
法医学始建于1980年，学科现为中国法医学会法医病理分委会和法医毒物分委会副主任委员单位、本科国家一流专业、山西省重点实验室、“1331”法医学山西省重点实验室、联合建设法庭毒物分析公安部重点实验室、法医学院士工作站、法医学山西省高等学校优秀创新团队、法医司法鉴定理论与关键技术山西省科技创新重点团队。“十一五～十三五”期间连续获得国家科技支撑计划、国家重点研发计划和国家科学基础性工作专项课题（子课题）十余项，2020获得国家自然科学基金重点项目1项。
职业病学始建于1951年，是我国最早建立的职业病学科之一，参与国家七五、八五尘肺攻关项目，开创大容量肺灌洗治疗尘肺的先河，获得2003年职业病诊断领域的国家科技进步二等奖。学科现为中华预防医学会劳动卫生与职业病分会副主任委员单位、国际职业卫生学会理事单位，中国诱变剂学会环境与神经退行性疾病专业委员会主任委员单位，山西省重点学科、山西省重点实验室。获得中华预防医学会科技二等奖2项，三等奖1项，山西省自然科学一等奖1项，二等奖1项，三等奖2项。2018年中华预防医学文章指出山西医科大学在近10年来职业卫生方向获得国家自然科学基金数目名列全国第一。
特种医学学科现有国家级人才 3 人，“国之名医”2 人，国家二级分会主任委员 1 人、副主任委员 5 人，省创新团队 3 个，国家级平台 4 个，设备总值 1.5 亿。学科重点开展放射性分子影像精准诊疗、法医司法鉴定、职业损害防治等关键理论与技术研究，着力解决特殊行业领域国际前沿理论与实践问题。