曹睿
博士
副研究员
研究方向:生物信息学
邮箱:
联系地址:山西省太原市新建南路56号
学习经历:
本科:2003年9月-2007年7月,山西农业大学,生物信息学专业,
硕士:2007年9月-2010年7月,华中农业大学(211),植物科学技术学院,作物遗传育种专业(生物信息学方向),毕业于国家重点实验室(作物遗传改良国家重点实验室),导师:孟金陵(中国第一位农学博士,973首席科学家)
博士:2015年9月至2022年6月,山西医科大学,再生生物学专业,毕业于教育部国家级实验教学师范中心、山西省重点实验室(出生缺陷与细胞再生山西省重点实验室),导师:解军(国家级实验教学师范中心主任、省重点实验室主任),毕业论文获得2022年度山西省优秀博士论文。
工作经历:
2010年8月-2012年7月,深圳华大基因研究院,高级项目总监。
2012年8月-2022年12月,山西省生物研究院有限公司,副研究员。
【1】神经管畸形的多源数据挖掘及其竞争性内源RNA网络调控机制的探究,山西省基础研究计划(面上项目),主持。
【2】 人Autotaxin(ATX)基因及其编码蛋白的生物信息学分析,山西省基础研究计划(青年项目),主持。
【3】基于多组学的谷子后熟米色变化机制研究,国家自然科学基金面上项目,参加(第二)。
【4】小米类胡萝卜素积累的分子机制研究,国家自然科学基金面上项目,参加(第二)。
【5】组蛋白甲基化修饰在神经管畸形发生中的作用及分子机制研究,国家自然科学基金面上项目,参加(第八)。
【6】基于肠道菌群大数据分析平台的构建和应用,山西省应用基础研究计划面上项目,参加(第二)。
【7】山西省生物医药产业技术创新潜力研究,山西省软科学,参加(第二)。
【8】基于16S rRNA 基因高通量测序与RT-PCR技术对人体肠道微生物菌群组成的研究,山西省应用基础研究计划青年项目,参加(第六)。
【9】高通量基因测序技术对肠道微生物组数据分析、健康评估及益生菌矫正功效的研究,山西省重点研发计划国际合作项目,参加(第六)。
【10】山西省晋城市北义镇鲁村及其周边村落双胞胎研究,山西省重点研发计划国际合作项目,参加(第六)。
[1] Rui Cao(曹睿),Jiaqi Li,Li Zhang,Jianting Li,Yuxiang Liang,Ruifang Ao,Ying Wang, Hang Li, Xin Lu, Zhizhen Liu,Hong Zhao,Jun Xie,Analysis of genes associated with both neural tube defects and neuroectodermal tumors, Med Sci Monit. 2022 Mar 23;28:e936079. doi: 10.12659/MSM.936079.
[2]Rui Cao(曹睿),Jun Xie,Li Zhang ,Abnormal methylation caused by folic acid deficiency in neural tube defects,Open Life Sciences,2022, 17(1): 1679-1688
[2] 曹睿,潘薇薇,赵邑,谢海军.人Autotaxin基因3个蛋白亚型的生物信息学比较分析[J].生物学通报,2019,54(04):61-64+66.(中文核心)
[3] 曹睿,赵邑,潘薇薇,曹鹏程,梁雅丽,谢海军.Autotaxin蛋白修饰性位点的生物信息学预测[J].生物学通报,2017,52(09):40-42.(中文核心)
[4] 曹睿,黎瑞源,龙艳,孟金陵,甘蓝型油菜及其亲本种BAC末端重复序列分析,湖北农业科学,2011,15(19):4073-4076(中文核心)
[5] RuiCao(曹睿),CuiLiang,Organization and distribution of SSRs in the genic region of Brassica rapa and Brassica-wide transfer ability of unigene -derived microsatellite markers”,《Proceedings of the 2nd Joint Symposium Between Chungnam National University and Shenyang Agricultural University》2010,5:33-49;(会议)
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[8] Gengyun Zhang,Xin Liu,Zhiwu Quan,Shifeng Cheng,Xun Xu,Shengkai Pan,Min Xie,Peng Zeng,Zhen Yue,Wenliang Wang,Ye Tao,Chao Bian,Changlei Han,Qiuju Xia,Xiaohua Peng,Rui Cao(曹睿),Xinhua Yang,Dongliang Zhan, Jingchu Hu,Yinxin Zhang,Henan Li,Hua Li,Ning Li,Junyi Wang,Chanchan Wang,Renyi Wang,Tao Guo,Yanjie Cai,Chengzhang Liu,Haitao Xiang,Qiuxiang Shi,Ping Huang,Qingchun ChenYingrui Li,Jun Wang,Zhihai Zhao & Jian Wang, Genome sequence of foxtail millet (Setaria italica) provides insights into grass evolution and biofuel potential, Nature Biotechnology,2012,30(6): 549-554 (SCI Top 1区,影响因子36.6)
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[1] Covid-19爬虫词云及感染模拟仿真系统,徐向超,解峰,徐金荣,曹睿,王瑞萍,温碧云,魏晔,证书号:软著登字第5874668号;
[2] Covid-19感染于疫苗研发趋势分析系统,徐向超,梁建军,赵琦,王暹,王永胜,曹睿,管策,朱政江,张成,崔婷,证书号:软著登字第6064893号;
[3] 红外图像颜色聚类及对比度增强系统,徐向超,朱政江,解峰,王丹婷,曹睿,温碧云,证书号:软著登字第6061892号。
[1] 解军,张琪,孟凡秀,于保锋,曹睿,温晓薇,杨巧艳,加三三,温丽敏,白欣艳,姚志坚,曾思衡,袁洋洋,张紫燕,张丽娜,一种复合组织工程皮肤的构建方法,专利类别:发明专利,专利号:ZL 2016 1 1213858.1,专利状态:已下证;