分享人：李卓阳

分享时间：2020.2.24

地点：线上会议（#腾讯会议：155-663-568）

参与人：宋珊、陈熙勐、武强、郭斌、张钧栋、智鹏、刘格良、李卓阳、王紫宁、陈浩然、周昊南、张昊军、耿杰、张力中等40余人

主要内容：

主要就文章《Text Mining Genotype-Phenotype Relationships from Biomedical Literature for Database Curation and Precision Medicine》相关内容及相关工具的应用进行了分享。介绍了用于数据库管理和精准医学的生物医学文献中基因型与表型关系的文本挖掘新工具。

迄今为止，尚无可用的文本挖掘工具能够为从生物医学文献中提取疾病-基因-突变的三向关系提供高精度的性能。本研究开发了文本提取diz-gene-mutation三方关系的新框架，提供基于全文的文本挖掘方法，用于挖掘基因关联，并通过十种常见疾病，测试该方法的性能，建立了一个包含430个diz-gene-mutation关系及其对应的PMID的注释语料库。