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组会文献分享┃The concordance between RNA-seq and microarray data depends on chemical treatment and transcript abundance

 分享人:郑超越

分享时间:2022.4.6早9:00

地点:线上会议(#腾讯会议:274-674-903)

参与人:王琪、师高翔、高启超、武莉、刘格良、薛佳、郑超越、程灵婧、冯爽、孔腾、孙翔飞、李渊、陈浩然、常敏静、王灿、薛丹阳、黄泰、纪之琳、齐荣煊、李晨龙、郭仟禧、何田田、樊芙蓉、龚万里、张书贤、莫状、侯雅琪、吴静等60余人

主要内容:文章作者进行了一项全面研究,以评估RNA序列在识别DEG和开发预测模型方面与微阵列的差异和相似性。文章报告了对暴露于各种化学物质的大鼠肝组织中Affymetrix微阵列和Illumina RNA-seq描述的基因表达反应的比较分析结果。使用微阵列或RNAseq数据来生成每种化学品的DEG和MOA预测模型。评估该化学品(以下简称“处理效应”)对RNA-seq和微阵列之间的一致性以及使用每种技术生成的预测模型性能的影响。



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