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组会文献分享┃Inflated false discovery rate due to volcano plots:problem and solutions

 分享人:薛丹阳

分享时间:2022.6.22早9:00

地点:线上会议(#腾讯会议:530-719-001)

参与人:王琪、师高翔、高启超、武莉、刘格良、薛佳、郑超越、程灵婧、冯爽、孔腾、孙翔飞、李渊、陈浩然、常敏静、王灿、薛丹阳、黄泰、纪之琳、齐荣煊、李晨龙、郭仟禧、何田田、樊芙蓉、龚万里、张书贤、莫状、侯雅琪、吴静等60余人

主要内容:当应用Benjamini–Hochberg程序(BH)处理数据后仍有太多结果时,火山图用于选择最有意义的特征。火山图一般采用双重过滤程序,即调整后P值较小且估计效果较大的特征。尽管这种筛选方式很受欢迎,但它忽略了一个事实,即BH不能保证对筛选出的特征子集进行错误控制。因此,所选特征子集可能包括大量错误发现。在本文中,作者通过说明了与火山图选择相关的I型错误率。其中估计效果最大的特征很可能是假阳性结果。因此作者研究了两种使用双重过滤进行多重测试的替代方法:1、目前常用Ⅰ型错误控制技术及不足;2、作者提出的两种替代程序以控制I型错误。

 



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