分享人:孙翔飞
分享时间:2022.9.28早9:00
地点:线上会议(#腾讯会议:393-360-928)
参与人:王琪、师高翔、高启超、武莉、刘格良、薛佳、郑超越、程灵婧、冯爽、孔腾、孙翔飞、李渊、陈浩然、常敏静、王灿、薛丹阳、黄泰、纪之琳、齐荣煊、李晨龙、郭仟禧、何田田、樊芙蓉、龚万里、张书贤、莫状、侯雅琪、吴静等60余人
主要内容:分享了2021年2月发表在Cancers (Basel)期刊的文章《Novel Gene Signatures Predictive of Patient Recurrence-Free Survival and Castration Resistance in Prostate Cancer》。
本文应用稳健排序整合(RRA,Robust Rank Aggregation)方法对前列腺癌(PCa,prostate cancer)转录组进行分析,并鉴定了287个在去势抵抗型前列腺癌(CRPC,castration-resistant PCa)和激素敏感型前列腺癌(HSPC,hormone-sensitive PCa)之间差异表达的基因。对287个基因进行LASSO和逐步Cox回归分析,得到预测PCa中无复发生存率(RFS,recurrence-free survival)的6-gene signature,包括NPEPL1、VWF、LMO7、ALDH2、NUAK1和TPT1,被称为CRPC衍生预后模型(CRPCPS)。这6个基因中的3个(NPEPL1、LMO7和TPT1)构成了另一个能够区分CRPC和HSPC的signature。通过验证发现,CRPCPS预测了5/9队列中的RFS,并维持了按肿瘤分期、Gleason评分和淋巴结转移状态分层的患者的预后。它还预测了总生存率和无转移生存率。所有9个队列的C指数、校准图以及3个队列的ROC曲线证明了CRPCPS的稳健性。列线图分析证实了CRPCPS的临床适用性。因此,CRPCPS对于PCa中的RFS预测是有用的。