HNSC糖酵解预后相关基因的构建及验证项目小组简介
1. 项目小组简介：
研究方向：项目组主要研究疾病为头颈癌，研究方向为与糖酵解相关预后癌基因的鉴定及模型构建。
研究内容：差异基因的识别、GO功能和KEGG通路富集分析、生存分析、PPI网络的模块分析、hub基因在不同细胞类型中的表达、预后模型的构建等。
小组成员：胡雨婷 谢霖 郝佳炜 李楠 陈淼然 赵宇慧 张雅茹 马可欣 黄钰沣 刘梦婷
赵雯霏。
2. 研究课题/项目：
课题1：肿瘤预后
名称：HNSC糖酵解预后相关基因的构建及验证
研究内容：针对HNSC疾病，从代谢角度入手研究糖酵解相关基因在HNSC中的作用，通过单因素、LASSO、多因素分析，寻找出预后相关基因，建立HNSC的预后模型：同时进行基因通路以及疾病药物等分析，研究HNSC的预后及治疗情况。
3. 针对报名对象要求：
（1）具备一定的医学基础或者生物信息学基础，对生物信息学有较大的兴趣；
（2）具备一定的科研技能，熟悉专业文献检索与阅读。
4. 联系方式：
组长：常敏静
邮箱：changminjingdawang@163.com
小组长：胡雨婷
邮箱：1308021654@qq.com
副组长：谢霖
邮箱：xielin1009@163.com
副组长：郝佳炜
邮箱：pasf991312@163.com
生物数据库挖掘与分析项目小组简介
1. 项目小组简介：
本项目小组主要研究方向为TCGA、GEO、UCSC等多个生物数据库的挖掘与分析，Linux操作系统的学习与利用，python与R多种编程语言的学习与编写，文献相关的自然语言处理，RNA-seq的上下游分析以及高分SCI论文的学习与复现。
2. 研究课题/项目：
课题1：
名称：探究 AML患者骨髓细胞的全面表达谱
研究内容：（1）针对AML的高通量转录组数据，微阵列数据以及单细胞转录组数据的生物信息学分析； （2）机器学习算法建模与验证。
课题2：
名称：pubmed数据库的自然语言处理
研究内容：（1）针对pubmed中句子的语义相关性分析；（2）针对pubmed中句子语义结构的分析。
3. 针对报名对象要求：
（1） 有自主学习的能力；
（2） 具有一定的生物学基础；
（3） 对于编程有一定了解。
4. 联系方式：
组长：陈浩然
邮箱：chr991004@163.com
基于药物重定位平台的药物预测实验项目小组简介
1. 项目小组简介：
本项目小组主要研究方向为基于药物重定位平台的药物预测和实验验证以及生物数据挖掘和生物信息学分析。利用GEO、Oncomine、TCGA、TANRIC等数据库的信息挖掘与分析，筛选关键信息并行为学、电生理、分子生物学等实验手段的实验验证，R语言的初级与进阶学习分析。
2. 研究课题/项目：
课题1：
名称：基于药物重定位平台对阿尔茨海默病药物的预测与动物实验验证
研究内容：（1）基于药物重定位平台对阿尔茨海默病药物的预测分析；（2）动物实验：行为学，电生理，分子生物学实验，转录组测序及分析。
课题2：
名称：生物信息学数据的挖掘与应用
研究内容：（1）生物信息学数据的挖掘分析；（2）测序数据的分析；（3）SCI文章的复现。
3. 针对报名对象要求：
（4） 对生物学相关理论和实践具有好奇心；
（5） 具有一定的吃苦耐劳和刻苦钻研精神；
（6） 具有一定的生物学基础。
4. 联系方式：
组长：高启超
邮箱：qichaogao163@163.com
淋巴细胞亚群项目小组简介
1. 项目小组简介：
Meta 写作小组由张升校博士牵头带领，30余名本科生组成。主要研究Th17、breg、NK、Tfh等淋巴细胞亚群及其细胞因子在自身免疫病患者外周血中的含量变化，探索淋巴细胞数量变化与自身免疫病间的关系。通过文献阅读、写作讲解等方式，培养本科生文献阅读与写作经验。
2. 研究课题/项目：
目前项目组主要对系统性红斑狼疮、类风湿关节炎、干燥综合征、皮肌炎等多种自身免疫病患者外周血中NK细胞、breg细胞、Tfh细胞等细胞的含量进行分析，就淋巴细胞数量变化与疾病的发病机制展开讨论。未来，我们将对更多种类的淋巴细胞及自身免疫性病间的关系展开研究，以期为更多的创新治疗理念提供循证医学证据。
3. 针对报名对象要求：
(1) 山西医科大学四年制、五年制、八年制本科生；
(2) 热爱科学事业，具备较强的责任意识和良好的团队精神；
(3) 有一定的论文阅读检索经验、文章写作能力；
(4) 具备一定的实验室经验、生物学基础者优先。
4. 联系方式：
组长：苏勤怡
邮箱：qinyisu2019@163.com
副组长：周昊南
邮箱：HaonanZhou4869@163.com
基于药物重定位平台的生物信息分析项目小组简介
1. 项目小组简介：
本项目小组主要研究方向为药物重定位平台的构建、基于药物重定位平台与生物组学数据库的药物预测、基于GEO、TCGA、GTEx等多种组学数据库及整合机器学习方法的生物信息挖掘与分析、python、R语言编程基础学习及项目实战、高分SCI论文的学习及复现。本小组旨在通过文献学习、论文撰写和数据分析项目实战等方式，培养本科生文献阅读及写作、数据分析实践能力。
2. 研究课题/项目：
课题1：
名称：肾透明细胞癌的多组学分析
研究内容：（1）针对肾透明细胞癌基因组、表观遗传组以及多种转录组测序数据的生物信息学分析；
（2）基于机器学习预测算法的多组学模型的构建与验证。
课题2：
名称：药物重定位平台的构建以及
研究内容：（1）基于python爬虫库的多种疾病组学、药物组学数据库的数据爬取；
（2）药物重定位算法的文献学习及算法设计优化。
课题3：
名称：机器学习算法在多种自身免疫性疾病、肿瘤发病机制及药物预测治疗研究中的应用
研究内容：（1）相关文献学习及综述文章撰写。
3. 针对报名对象要求：
（1）山西医科大学四年制、五年制、八年制本科生；
（2）具有较强的团队意识及责任心，对探索生命科学的奥秘感兴趣；
（3）具有一定的自主学习能力；
（4）有一定的文献检索、阅读及写作经验；
（5）具备一定的数据分析处理能力、编程能力以及生物医学基础者优先。
4. 联系方式：
组长：刘格良
邮箱：sx_liugeliang@163.com
免疫调节疗法项目小组简介
1. 项目小组简介：
免疫调节疗法项目小组由张升校博士牵头带领，临床医学（“5+3”一体化）本科生苏勤怡、罗静、狄靖凯三名成员构成。主要研究IL-2、西罗莫司等免疫调节疗法治疗自身免疫病患者的有效性安全性。旨在通过检索数据库、写作指导等方式，培养本科生文献阅读与写作经验，专注免疫调节治疗领域攻关。
2. 研究课题/项目：
目前项目组主要就系统性红斑狼疮、类风湿关节炎、干燥综合征、皮肌炎等多种自身免疫病患者接受IL-2、西罗莫司等治疗是否有效和安全展开研究，探索其他免疫调节疗法。未来，我们将探索更多免疫相关治疗，为自身免疫性疾病的多样化新型治疗提供循证医学证据。
3. 针对报名对象要求：
(1) 山西医科大学四年制、五年制、八年制本科生；
(2) 热爱科学事业，具备较强的责任意识和良好的团队精神；
(3) 有一定的论文阅读检索经验、文章写作能力；
(4) 具备一定的实验室经验、生物学基础者优先。
4. 联系方式：
组长：苏勤怡
邮箱：qinyisu2019@163.com
副组长：罗静
邮箱：jing_luo132@163.com
HER2阳性乳腺癌项目小组简介
1. 项目小组简介：
本项目小组主要研究方向为基于基因组及转录组数据HER2阳性型乳腺癌预后风险模型的开发及验证。研究内容主要为探讨HER2阳性型如下你爱铁死亡和肿瘤微环境的相互作用关系，构建一种预测HER2阳性型乳腺癌预后、免疫景观和治疗反应的糖酵解相关风险模型。
研究成员包括来自山西医科大学临床医学（“5+3”一体化）专业的硕士研究生及本科生。
2. 研究课题/项目：
课题1：
名称：基于铁死亡相关基因的HER2阳性型乳腺癌预后风险模型的构建和表征
研究内容：本项目拟从转录组测序数据集（bulk RNA-seq）数据集入手，通过生物信息学手段筛选出与HER2阳性型乳腺癌患者预后相关的最佳铁死亡相关基因集，并构建预后模型，对不同风险组患者的免疫浸润概况、化疗药物和分子靶向药物的敏感性进行评估，揭示目标基因的表达与HER2阳性型乳腺癌进展的关联，为采用铁死亡相关相关基因作为HER2阳性型乳腺癌早期诊断评估的生物标志物奠定了基础。
3. 针对报名对象要求：
(1) 报名对象为本科生，时间相对充裕，能够与学业兼顾；
(2) 具备有一定的生物信息学基础，对生物信息学及其应用有一定的兴趣；
(3) 具备有一定的文献检索与阅读整理文献能力或有撰写论文的经历。
4. 联系方式：
史晋宇（小组长）
邮箱：494652276@qq.com
文蕊（副组长）
邮箱：1440764559@qq.com
侯思佳（副组长）
邮箱：housj2017@163.com
席羽佳（副组长）
邮箱：xyj20001030@163.com
类风湿性关节炎基因分型项目小组简介
1. 项目小组简介：
本项目小组主要研究方向为基于生物信息学研究鉴定自身免疫病亚型
研究成员包括来自山西医科大学临床医学（“5+3”一体化）专业的硕士研究生及临床医学专业本科生。
2. 研究课题/项目：
课题1：类风湿性关节炎亚型识别
名称：Identification Differential Methylation Modification Patterns by M6A Regulator in Rheumatoid Arthritis Patients
研究内容：基于m6A甲基化调节酶，鉴定类风湿性关节炎中的不同m6A甲基化模式，识别不同亚型中特征免疫细胞和RA相关生物学通路，并表征其临床特点。
3. 针对报名对象要求：
要求报名对象为临床医学相关专业二、三年级本科生，具备一定的文章撰写能力，有实验室经历或文章写作经历者优先，本硕连读同学优先。
4. 联系方式：
组长：宋珊
Email：1556767886@qq.com
肺癌hub基因鉴定及预后模型构建项目小组简介
1 项目小组简介：
项目组主要研究疾病为肺癌，研究方向为肺癌hub基因的鉴定及预后模型构建，主要研究内容为差异基因的识别、GO功能和KEGG通路富集分析、生存分析、PPI网络的模块分析、hub基因在不同细胞类型中的表达、预后模型的构建等。
小组成员：王灿 李芸 宋婧妍 郑蕾蕾 张乐从 陈雨欣 郭星怡 丰子涵 王馨怡
2. 研究课题/项目：
课题1：
名称：基于上皮间质转化的基因特征在肺鳞癌预后、免疫和药物治疗中的综合分析
研究内容：基于癌症基因组图谱（TCGA）和上皮间充质转化基因数据库和分子特征数据库收集数据，建立了基于上皮间质转化的肺鳞癌遗传特征，可以用于预测肺鳞癌患者预后的模型，并且构建了转录因子调控网络，对于探索肺鳞癌新的临床治疗策略具有参考意义。
3. 针对报名对象要求：
（1）具备一定的生物信息学基础，对生物信息学有较大的兴趣；
（2）具备一定的科研技能，熟悉专业文献检索与阅读；
（3）态度认真，严谨仔细。
4. 联系方式：
组长：王灿
邮箱：wangcangongzhul@163.com
小组长：李芸
邮箱：457627332@qq.com
胃癌预后模型开发及验证项目小组简介
1. 项目小组简介：
本项目小组主要研究方向为基于基因组及转录组数据胃癌预后风险模型的开发及验证。研究内容主要为探讨胃癌EMT（上皮间质转化）代谢和肿瘤微环境的相互作用关系，构建一种预测胃癌预后、免疫景观和治疗反应的EMT相关风险模型。研究成员包括来自山西医科大学临床医学（“5+3”一体化）专业的硕士研究生及本科生。
2. 研究课题/项目：
课题1：
名称：基于EMT代谢相关特征的胃癌预后风险模型的构建和表征
研究内容：本研究旨在基于癌症基因组图谱（TCGA）胃癌数据集及胃癌临床样本，建立EMT代谢相关特征相关胃癌预后风险模型，用于预测胃癌患者的预后，识别出高风险胃癌患者。进一步明确EMT在胃癌中预后相关的重要作用，为今后胃癌的诊治找到新的可能的潜在靶点。
3. 针对报名对象要求：
（备注：如：要求报名对象为本科生/研究生，具备一定的实验室经验/生物学基础/撰写文章能力等）
4. 联系方式：
组长：王琪
邮箱：dr_wangqi_2020@163.com
小组长：张耀辰
邮箱：z1169062561@163.com
小组长：胡净喜
邮箱：1217923829@qq.com
新冠项目小组简介
1. 项目小组简介：
由新型冠状病毒（SARS-CoV-2）引起的新型冠状病毒（COVID-19）疫情在全球范围内蔓延，并且造成了大量感染和死亡。由于自身免疫性疾病（ADs）患者在治疗过程中使用免疫抑制剂或抗细胞因子药物治疗，这类患者在新冠大流行期间的情况值得研究。新冠项目小组由张升校博士牵头带领，临床医学（“5+3”一体化）本科生苏勤怡、张妍、赵冰如、尹心语、史亚茹、王泷婷、陈婷婷、郝新颖、江钟清、唐张甜、张杰翔、黄周馨十二名成员构成。本项目组主要研究自身免疫性疾病患者在使用糖皮质激素，传统或生物抗风湿药（cs/bDMARDs）治疗的情况下，对于2019冠状病毒病（COVID-19）的发病率和临床转移的影响。项目小组成员来自山西医科大学，横跨三个年级的不同学科，优势互补分工合作，在组长苏勤怡的带领下，项目研究稳步进行。
2. 研究课题/项目：
本项目组旨在研究使用糖皮质激素，传统或生物抗风湿药（cs/bDMARDs）治疗的自身免疫性疾病患者中2019冠状病毒病（COVID-19）的发病率和严重程度。在新冠大流行期间，通过本研究期望对未来自身免疫性患者提供用药指导和建议。
3. 针对报名对象要求：
(1) 山西医科大学四年制、五年制、八年制本科生；
(2) 热爱科学事业，具备较强的责任意识和良好的团队精神；
(3) 有一定的论文阅读检索经验、文章写作能力；
(4) 具备一定的实验室经验、生物学基础者优先。
4. 联系方式：
组长：苏勤怡
邮箱：qinyisu2019@163.com
副组长：张妍
邮箱：yanzhang20210@163.com
新冠综述写作项目小组简介
1. 项目小组简介：
新冠综述写作小组由张升校博士牵头带领，临床医学（“5+3”一体化）本科生苏勤怡、罗静、李欣雨、李乾、刘亚茹、毕晓彤、苏唱、赵芳八名成员构成。主要研究新冠患者与自身免疫病患者维持免疫自稳的机制。旨在通过文献检索与阅读、写作讲解等方式，培养本科生文献阅读与写作经验，专注免疫平衡领域攻关。
2. 研究课题/项目：
目前项目组主要就新冠及系统性红斑狼疮、类风湿关节炎等自身免疫病患者维持免疫自稳的机制展开研究，探索免疫细胞及其相关细胞因子与免疫耐受间的关系。未来，我们将探索更多自身免疫性疾病，以期为新冠新型有效治疗提供思路。
3. 针对报名对象要求：
(1) 山西医科大学四年制、五年制、八年制本科生；
(2) 热爱科学事业，具备较强的责任意识和良好的团队精神；
(3) 有一定的论文阅读检索经验、文章写作能力；
(4) 具备一定的实验室经验、生物学基础者优先。
4. 联系方式：
组长：苏勤怡
邮箱：qinyisu2019@163.com
副组长：罗静
邮箱：jing_luo132@163.com
免疫耐受综述项目小组简介
1. 项目小组简介：
（备注：简要介绍该项目组主要研究方向、内容及小组成员）
免疫综述写作小组由张升校博士牵头带领，临床医学（“5+3”一体化）本科生苏勤怡、狄靖凯、尹心语、高立涛四名成员构成。主要研究自身免疫病患者维持免疫自稳的机制。旨在通过文献阅读、写作讲解等方式，培养本科生文献阅读与写作经验，专注免疫平衡领域攻关。
2. 研究课题/项目：
（备注：包括在研的和未来计划的）
目前项目组主要就系统性红斑狼疮、类风湿关节炎、干燥综合征、皮肌炎等多种自身免疫病患者维持免疫自稳的机制展开研究，探索treg细胞与免疫耐受间的关系。未来，我们将探索更多细胞亚群，以期为更多的创新治疗理念提供循证医学证据。
3. 针对报名对象要求：
（备注：如：要求报名对象为本科生/研究生，具备一定的实验室经验/生物学基础/撰写文章能力等）
（1）山西医科大学四年制、五年制、八年制本科生。
（2）热爱科学事业，具备较强的责任意识和良好的团队精神。
（3）有一定的论文阅读检索经验、文章写作能力。
（4）具备一定的实验室经验、生物学基础者优先。
4. 联系方式：
（备注：小组组长与副组长的邮箱、电话、微信号等）
组长：苏勤怡
邮箱：qinyisu2019@163.com
电话：17836217749
微信号：aasaaqaay
副组长：尹心语
邮箱：yxy1529982700@163.com
电话：18834892859
微信号：yxy18834892859
三阴性乳腺癌预后模型开发及验证项目小组简介
1. 项目小组简介：
本项目小组主要研究方向为基于基因组及转录组数据三阴性乳腺癌预后风险模型的开发及验证。研究内容主要为探讨三阴性乳腺癌糖酵解代谢和肿瘤微环境的相互作用关系，构建一种预测三阴性乳腺癌预后、免疫景观和治疗反应的糖酵解相关风险模型。
研究成员包括来自山西医科大学临床医学（“5+3”一体化）专业的硕士研究生及本科生。
2 研究课题/项目：
课题1：
名称：基于糖酵解代谢相关特征的三阴性乳腺癌预后风险模型的构建和表征
研究内容：本研究旨在基于癌症基因组图谱（TCGA）三阴性乳腺癌数据集及三阴性乳腺癌临床样本，建立糖酵解代谢相关特征相关三阴性乳腺癌预后风险模型，用于预测三阴性乳腺癌患者的预后，识别出高风险三阴性乳腺癌患者。进一步明确糖酵解在三阴性乳腺癌中预后相关的重要作用，为今后三阴性乳腺癌的诊治找到新的可能的潜在靶点。
3. 针对报名对象要求：
（备注：如：要求报名对象为本科生/研究生，具备一定的实验室经验/生物学基础/撰写文章能力等）
4. 联系方式：
组长：张一凡
邮箱：zyf_15535404006@163.com
小组长：王杏如
邮箱：xingru_write@163.com
三阴性乳腺癌预后模型小组简介
1.项目小组简介：
本项目组主要进行疾病的生信分析，从预后、分型、治疗等角度对疾病进行研究，目前主要从事乳腺癌的预后研究。小组组长为山西医科大学第二医院研究生赵蓉，副组长为山西医科大学临床医学本科生张雅静、袁周君、张译文，小组其他成员均为山西医科大学临床医学本科生周雨欣、姜思意、李嘉颐、姚冠宇。
2.研究课题/项目：
课题1：
名称：TNBC的预后模型
研究内容：针对TNBC疾病，从EMT角度入手研究EMT-related基因在TNBC中的作用，通过单因素、LASSO、多因素分析，寻找出相关EMT基因，建立TNBC的预后模型；同时进行基因通路以及疾病药物等分析，研究TNBC的预后及治疗情况。
3.针对报名对象要求：
(1) 报名对象需为本科生，时间相对充裕，能兼顾学业和项目；
(2) 需要具备一定的生物信息学基础，对生信方面有兴趣；
(3) 熟悉专业文献检索，具备一定的文献阅读能力。
4.联系方式：
组长：赵蓉
邮箱：zhaorong_838@163.com
副组长：张雅静
邮箱：1030387348@qq.com
副组长：袁周君
邮箱：Yuanzhoujun123@163.com
副组长：张译文
邮箱：1500173930@qq.com
