文献标题:A comprehensive transcriptome signature of murine hematopoietic stem cell aging[1]

小组负责人:陈浩然
组员:王洋、王琪、黄泰、李渊、齐荣轩、薛丹阳、王灿、胡静怡
该文章整合大量造血干细胞(HSC,hematopoietic stem cell)衰老数据,探究小鼠造血干细胞中稳定的表达谱特征,通过建立的HSC衰老标志物,对单细胞数据进行分群,并利用机器模型算法构建模型,验证模型的有效性,利用实验验证关键分子Selp在造血干细胞衰老的重要作用。此次文献复现活动由王洋、王琪、黄泰、李渊、齐荣轩、薛丹阳、王灿、胡静怡负责数据的收集和标准化预处理,由陈浩然进行结果复现,目前已经完成生信部分复现。
复现结果:
https://mp.weixin.qq.com/s/vWevNefRGUUTIWfa67u28g
https://mp.weixin.qq.com/s/5dckU4eBKeNSixwomAzy-g
https://mp.weixin.qq.com/s/8XiIqB_PbZSjiYdnj3mqsw
负责人联系邮箱:chr991004@163.com
【参考文献】
[1]. Flohr Svendsen A, Yang D, Kim K, et al. A comprehensive transcriptome signature of murine hematopoietic stem cell aging. Blood. 2021;138(6):439-451. doi:10.1182/blood.2020009729