外泌体（Exosomes）是细胞分泌到胞外的一种纳米级内吞囊泡（40-160nm），含有丰富的内含物（包括核酸、蛋白和脂质等），可以调节受体细胞的行为，并可用作疾病的循环生物标记物。
今天小编给大家介绍一个在线外泌体数据库：exoRBase（http://www.exorbase.org）。它是一个环状RNA（circRNA），长非编码RNA（lncRNA）和信使RNA（mRNA）的存储库，这些RNA来源于人类血液外泌体的RNA-seq数据分析，还包括已发表文献的实验验证。
该数据库基于标准化的RNA-seq数据（涵盖正常个体和不同疾病的患者）对RNA表达谱进行整合和可视化。旨在收集和表征人血液外泌体中所有长的RNA。目前包含58330个circRNA、15501个lncRNA和18333个mRNA，并提供了注释、表达水平和可能的来源组织。
这里小编给大家简要介绍一下该数据库的使用。
1. Browse
exoRBase数据库为用户提供了提取感兴趣的RNA候选物的功能。这里我们点击“浏览”页面的“lncRNA和mRNA”部分。
以结直肠癌为例，我们可以研究的任何潜在血液生物标志物。
首先，从“Sample types”选项的下拉列表中选择“CRC”。其次，我们可以通过在”Tissue specificity”选择结肠，“Different group”选项中选择“CRC（up）”来选择在CRC样本中表达上调的RNA。当然，我们也可以通过“Tissue specificity”，“Detection frequency”，“Expression rank”和“Validation”选项进一步过滤搜索结果。
最后，单击选项部分底部的“搜索”按钮。
浏览结果以表格形式显示，该举例结果主要为mRNA在CRC样本中的表达上调和结肠组织中的特异性表达情况，该RNA可以被认为是结直肠癌患者的血液生物标志物候选物。
点击Gene symbol列内基因的超链接，可转至该基因在其他疾病中的表达情况、基因的详细基本信息及通往其他数据库的链接。
可以通过单击表中的“Related circRNA”列来检索有关位于基因内或附近的circRNA的信息。
1. Search
可以从3个方面对基因进行搜索，这里以lnRNA and mRNA为例，在Required框内输入基因名称'TRAF3,GAB2,SNX1'。
搜索结果将显示一个图表，该图表显示所有收集到的样品中的表达水平。“NP”代表正常人，“ CHD”代表冠心病，“ CRC”代表结直肠癌，“ HCC”代表肝细胞癌，“ PAAD”代表胰腺腺癌，“ BC”代表乳腺癌，WhB'代表全血。
此外，我们可以通过单击“热图”按钮将图切换为热图
并列出“TRAF3,GAB2,SNX1”的简要说明的表格。
exoRBase还提供了一个箱形图，可通过直接单击基因名称或表中的最后一列来访问该图。通过这些图，我们可以快速概览所有外泌体样本组中TRAF3,GAB2,SNX1的表达水平。
1. Home
通过搜索框，输入基因名称可以实现快速搜索。具体操作及结果解释同“2”。
环状circRNA与外泌体研究策略与生信实操研讨会
时间：2022年5月14-15日参会方式：腾讯会议
【课程背景】
环状RNA（circRNA）和外泌体（exosome）是当今生命科学领域发展迅速的前沿领域。在高等生物中，存在着一个巨大的、尚未被完全发现circRNA世界，circRNA研究将从全新的角度揭示生命调控的分子机制，并为人类疾病的诊断和防治提供理论依据和新的技术，受到科学家们广泛关注。外泌体可以由多种类型细胞释放，其中含有丰富的miRNA、circRNA等调控性非编码RNA，在细胞间信息交流中发挥重要调控功能。circRNA和外泌体研究不仅受到主流学术期刊的青睐，还是国家自然科学基金等鼓励申报的重要领域。通过参加此次研讨班，有助于缩短发表论文和获得研究基金的周期。因此，我们研究设计了这次环状circRNA与外泌体研究策略与生信实操班，通过集中和系统的学习，可以掌握环状circRNA与外泌体分析与设计相关的策略、数据库、在线工具、本地软件的使用。
如果您是从事医学、动物、植物学等生物学方向的科研工作者（学术），无需有工具操作和编程语言基础，都可以来参加本次培训班。
示例图外泌体circRNA调控机制图（PMID: 32600329，Mol Cancer，2020）
示例图外泌体circRNA功能机制图。（PMID: 32713345，Mol Cancer . 2020）
【专家介绍】
S教授，博导，长期专注于circRNA研究，主持多项国家自然科学基金项目，发表多篇高水平学术论文。具有扎实的理论基础和丰富的研究经验，熟悉调circRNA研究现状，精通研究策略和技术方法。
宋伟博士，中国精准医疗学会委员。
成果：参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请；肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建；完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。
研究方向：有近十年的生信分析经验，擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等，精通perl、R等编程语言。
培训经历：在北京、上海、广州、沈阳、成都、武汉等城市举办过十几场培训班。培训的对象有：医生、学生、科研工作者、生信爱好者等。
【学习预期】
1. 掌握circRNA的调控模式、研究策略、常用研究技术；
2. 掌握外泌体分离、检测和常用数据库使用方法；
3. 熟悉circRNA、外泌体等相关国家自然科学基金标书撰写思路。
4. 掌握circRNA-miRNA分析、预测常用数据库使用方法；
5. 掌握circRNA-RBP分析、预测常用数据库使用方法；
6. 掌握circRNA在疾病中调控下游功能通路机制分析方法。
主办方：上海循掘生物科技中心
会议时间**：**2022年5月14-15日
会议地点**：线上：**腾讯会议网络会议室
通过腾讯会议直播，主办方会后统一提供录屏。
收费标准：3000元/人；
优惠政策：
1.提前确认报名及转账的，可以提前拿到学习材料
1. 三人组团报名，每人优惠100元
2. 四人组团报名，每人优惠200元，
3. 六人组团报名缴费，可免1人会务费！
可以开正规会务发票，纸质邀请函（盖红章）。
注意事项：使用win10以上系统的电脑。
交费方式：
A：银行转账
账户名称：上海循掘生物科技中心账户号：1001064709100016561
开户行：中国工商银行上海市永泰路支行
B：支付宝转账
收款人：yonghong1028@126.com户名:金永红
C：公务卡支付
课程安排
培训过程生成图片示例图：
示例图ceRNA网络图
示例图非编码RNA调控网络及功能富集分析（pathway）
circRNA参与的调控桑基图sangkey
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