生物信息学分析发现肝细胞肝癌诊疗新靶点——范益民课题组研究成果在权威学术期刊发表
据2020全球肿瘤流行病统计数据(GLOBOCAN 2020)估计,全世界肝癌新发病例约90.57万,死亡病例约83.02万,居恶性肿瘤发病率第6位,死亡率第3位。其中,中国人群肝癌新发病例和死亡病例分别占全世界的45.27%和47.12%。虽然肝癌的治疗手段包括手术切除、肝移植、介入治疗、靶向治疗及免疫治疗等多种形式,但患者预后仍不能令人满意。
生物信息学对于现代生物学和医学数据的分析具有重大意义,其研究成果将对人类社会和经济产生巨大推动作用。通过生物信息学的方法,对基因组学,转录组学,蛋白质组学,微生物组学,表观遗传学,代谢组学,免疫组学等各种不同的组学数据进行分析,对疾病机制机理研究,相关基因的发现,药物靶点分析,药物发现,以及疾病的个性化治疗提供了新的见解与解决方案。
近日,山西医科大学第一医院范益民教授团队通过生物信息学分析发现,PDZ-binding kinase (PBK)在肝细胞肝癌患者体内表达明显增高,且与患者不良预后及免疫治疗密切相关,PBK可作为肝细胞肝癌预后不良的生物标志物和潜在的免疫治疗靶点。该研究结果以题为“High expression of PDZ-binding kinase is correlated with poor prognosis and immune infiltrates in hepatocellular carcinoma”的研究报告在《World Journal of Surgical Oncology》在线发表。课题组博士研究生慕伟为该论文的第一作者,课题组负责
人范益民教授为通讯作者。
该研究经过多个独立数据库证实,PBK在肝细胞肝癌组织中表达极高,且PBK高表达组患者的预后较差,是影响患者预后的独立危险因素。另外,本研究首次分析了PBK的表达与肝细胞肝癌患者临床病理特征的关系,首次通过ROC曲线确定了PBK在肝细胞肝癌患者中的诊断价值,特别是首次报道了PBK的表达与肿瘤浸润淋巴细胞、趋化因子和受体之间的相关性。这些研究结果有助于我们建立以PBK为核心的肝细胞肝癌诊疗研究方向,为我们后续研究做理论基础。
部分研究数据和图示