山西医科大学保卫部（处）是学校党委和行政领导下的职能部门，主要负责校园安全稳定和治安保卫等工作。下设治安科、消防科、政保科、校卫队、户政科、办公室，现有正式干部职工18人，其中处长1人，正副科长7人，工作人员10人，另有临时工（含校卫队及消防总控室人员）31人。
多年来，保卫处在校党委、行政的正确领导及上级有关部门的指导下，认真贯彻“预防为主、打防结合”的指导思想，狠抓校园的政治稳定和治安综合治理工作的落实，实行治安保卫工作责任制，打击和预防犯罪，维护学校安全稳定。使学校达到“八无”，即无政治案件；无师生员工间纠纷转化为刑事案件；无经济纠纷引起刑事治安案件；无师生员工间纠纷或其他原因引起自杀、他杀；无火灾事故；无师生械斗；无校园交通伤亡事故；无食物中毒事故发生、无赌、毒、黄事件的发生。营造了良好的治安环境、有序的交通环境、安全的消防环境、纯净的文化环境、和谐的育人环境。连续3年被山西省政府授予“生产安全先进单位”，并获得“山西省高等学校安全保卫工作优胜杯”、“综合治理先进单位”等光荣称号。