煤炭环境致病与防治教育部重点实验室于2023年3月获批建设，主体位于山西医科大学中都校区实体位于至公楼（公共卫生学院楼）和至理楼（科技楼）和明辨楼二层，规划科研和办公用房面积约8770 m²，包括开放实验区、超算中心、生物样本库及转化研究中心。实验室现有大型仪器设备价值超1.88亿元。实验室拥有一支院士领衔、国家级人才和中青年科研人才为骨干的科研团队，现有固定人员83人，其中教授37人、副教授33人，博士生导师38人，硕士生导师56人。现已形成五个稳定且具有交叉学科背景的科研创新团队，并设立5大重点研究方向：（1）煤炭环境特定污染物的“环境—基因”分子交互作用机制研究；（2）基于队列的煤炭环境污染物暴露组学与疾病风险评估；（3）煤炭环境健康损害监测与预警；（4）煤炭环境健康损害防治技术与转化研究；（5）基于反向病原学开展煤炭环境潜在致病微生物研究。

实验室立足山西，聚焦煤炭健康问题，核心目标是：应对煤炭环境“致病机制复杂、危害因素难以识别、防控难以精准”三大挑战，聚焦“致病机制-风险评估-防治转化”全链条防控理论和技术难题，构建煤炭环境致病与防治理论与技术体系，实现煤炭环境高发疾病从被动防治向主动防控的重要转变，为解决煤炭环境公共卫生问题和构建人类卫生健康共同体提供“解决方案”。