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研究进展
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肺癌hub基因鉴定及预后模型构建项目

发布时间:2022-05-03

1.研究目的:

主要研究疾病为肺癌,研究方向为肺癌hub基因的鉴定及预后模型构建,主要研究内容为差异基因的识别、GO功能和KEGG通路富集分析、生存分析、PPI网络的模块分析、hub基因在不同细胞类型中的表达、预后模型的构建等。

小组成员:王灿、李芸、宋婧妍、郑蕾蕾、张乐从、陈雨欣、郭星怡、丰子涵、王馨怡

2.研究课题/项目:

课题名称:基于上皮间质转化的基因特征在肺鳞癌预后、免疫和药物治疗中的综合分析

研究内容:基于癌症基因组图谱(TCGA)和上皮间充质转化基因数据库和分子特征数据库收集数据,建立了基于上皮间质转化的肺鳞癌遗传特征,可以用于预测肺鳞癌患者预后的模型,对于探索肺鳞癌新的临床治疗策略具有参考意义。

3.研究进展:

目前已经完成了论文的群补内容分析和文章的撰写。主要由以下几部分组成:

(1)完成了TCGA数据采集及处理;

(2)从MsigDB数据库下载了EMT相关基因;

(3)筛选了差异表达的EMT基因;

(4)基于单因素、LASSO、和多因素回归分析构建了预后模型,并基于GEO数据库对模型进行了验证。

(5)肺癌肿瘤免疫微环境分析。

4.下一步研究计划:

为了增强模型的可靠性和临床应用能力,计划收集就诊于山西医科大学第一医院肺鳞癌及及癌旁样本,通过RT-qPCR检测预后模型构建基因的表达水平。



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