1.研究目的:
主要研究疾病为肺癌,研究方向为肺癌hub基因的鉴定及预后模型构建,主要研究内容为差异基因的识别、GO功能和KEGG通路富集分析、生存分析、PPI网络的模块分析、hub基因在不同细胞类型中的表达、预后模型的构建等。
小组成员:王灿、李芸、宋婧妍、郑蕾蕾、张乐从、陈雨欣、郭星怡、丰子涵、王馨怡
2.研究课题/项目:
课题名称:基于上皮间质转化的基因特征在肺鳞癌预后、免疫和药物治疗中的综合分析
研究内容:基于癌症基因组图谱(TCGA)和上皮间充质转化基因数据库和分子特征数据库收集数据,建立了基于上皮间质转化的肺鳞癌遗传特征,可以用于预测肺鳞癌患者预后的模型,对于探索肺鳞癌新的临床治疗策略具有参考意义。
3.研究进展:
目前已经完成了论文的群补内容分析和文章的撰写。主要由以下几部分组成:
(1)完成了TCGA数据采集及处理;
(2)从MsigDB数据库下载了EMT相关基因;
(3)筛选了差异表达的EMT基因;
(4)基于单因素、LASSO、和多因素回归分析构建了预后模型,并基于GEO数据库对模型进行了验证。
(5)肺癌肿瘤免疫微环境分析。
4.下一步研究计划:
为了增强模型的可靠性和临床应用能力,计划收集就诊于山西医科大学第一医院肺鳞癌及及癌旁样本,通过RT-qPCR检测预后模型构建基因的表达水平。