学院科研工作近年来取得跨越式发展，形成基础研究与临床应用并重的创新格局。近五年累计承担国家级科研项目34项（含国家自然科学基金、国家社科基金及国家重大专项子课题），主持省部级及以上课题120余项，科研经费规模持续扩大。在基础研究领域，发表SCI论文380篇，其中I区顶级期刊论文29篇、II区高水平论文118篇。科研成果转化成效显著，获省部级科技奖励36项，申请发明专利32件，构建起完整的"基础发现-技术研发-产业应用"创新链条。

作为多个国家级学术组织驻地，学院深度参与学科顶层设计。依托中国诱变剂学会环境与神经退病专委会等平台，主导制定多项行业标准。实验室建设实现历史性突破，形成"校级重点实验室-省级重点实验室-教育部重点实验室"三级体系：2016年率先建成环境健康损害山西省重点实验室，2018年拓展建立重大疾病风险评估实验室，2020年成为山西省重大传染病防控诊治实验室核心成员，2023年获批煤炭环境致病与防治教育部重点实验室，2024年院士工作站的设立标志着反向病原学研究进入新阶段。

在学科交叉融合方面，学院建成7大校级创新平台，涵盖从生命早期健康到老年退行性疾病的全周期研究；黄河流域生态公共卫生安全研究中心聚焦区域特色健康问题；环境污染与重大慢病研究中心建立了大型队列研究数据库；营养科学研究所为我省食品营养健康体系的构建做出重要共享。这些平台通过"学科+地域+产业"三维联动模式，在尘肺病防治、食源性疾病预警、儿童发育障碍干预等领域取得突破性进展，多项成果被纳入省级公共卫生政策。徐建国院士领衔的反向病原学研究院士工作站，更是在新发传染病预警技术上实现重大理论创新，为构建山西生物安全防线提供了支撑。