山西医科大学附属山西省眼科医院孙斌教授课题组开展基于高通量测序技术及培养组学的眼鼻咽部微生物菌群研究取得新进展

由于眼部、鼻部及口咽部在解剖学上相通，故比较中国人群健康和疾病状态下眼、前鼻孔和口咽的微生物群落，揭示不同人群眼鼻咽部微生物菌群的生物学信息。

高通量测序结果显示健康人眼部和鼻部的微生物群落组成相似，与口咽部不同。本研究通过高通量测序技术共获得38个门，94个纲，215个目，386个科，744个属。培养组学及分离株基因组研究结果显示,眼鼻咽部分离培养获得的26个菌属和55个菌种中，眼部和鼻部表皮葡萄球菌分离率最高，口咽部唾液链球菌分离率最高。ANI和Blast比较发现溶血性葡萄球菌、金黄色葡萄球菌及表皮葡萄球菌在眼鼻咽三个部位基因组相似性高。

图1健康人眼鼻咽部微生物菌群Beta多样性（PCA）：属水平

研究表明，高通量测序技术、培养组学和单菌株全基因组测序方法相结合，可较为完整地提供眼鼻咽部微生物群落“属”、“种”水平分类学特征。建立重点菌种的培养、鉴定和全基因组信息比较技术体系，可实现眼部及邻近部位菌种的精准溯源。为今后探讨眼鼻咽部感染性疾病的发病机制、预防和新型微生态治疗提供参考。