全世界有记载的鱼类多达22000种以上，是取之不尽的实验材料资源。由于鱼类终生生活在水中，材料易得、且绝大部分是体外受精、体外发育等，所以是毒性试验、环境监测、发育生物学、生理学、生态学、遗传学等研究常用的实验材料，在各个领域得到广泛应用。目前，鱼类实验动物没有统一的标准，大多数作为实验材，只能称为“用于实验的动物”。常用的品种有：
斑马鱼，原产于南亚，是一种常见的热带鱼。斑马鱼体形纤细，成体长3—4厘米，对水质要求不高。目前有约20个斑马鱼品系，其细胞标记技术、组织移植技术、突变技术、单倍体育种技术、转基因技术、基因活性抑制技术等已经成熟，且有数以千计的胚胎突变体，是研究胚胎发育分子机制的优良资源，已经成为最受重视的脊椎动物发育生物学模式之一。
青鱂起源于东亚的一种小型鱼种，易于饲养。因为有突变个体存在，最早被作为研究材料用于遗传学的分析工作。青锵有伙伴性的体色基因r，利用其等位基因可制出通过体色差异区别雌雄的系统非常方便。由于产卵是可控的，1994年, 青鱂作为脊柱动物的代表被送上太空，完成了从受精到个体的整个发育过程，实现了真正意义上“太空育种”。被广泛应用于生理学、生态学、内分泌学等各方面的研究。
新月鱼和剑尾鱼是热带鱼。新月鱼和剑尾鱼杂交后易产生黑色素瘤。剑尾鱼有23个种，因其属内的鱼有不同的表型，体色各异，所以通过杂交、回交等手段可进行基因遗传连锁研究。剑尾鱼的杂交黑色素瘤模型在肿瘤研究中是经典的模型。剑尾鱼对多种农药、重金属等毒物较敏感，同时还对某些鱼类病原体敏感性强，以及存在盲眼、畸形等诸多突变性状，适合作为动物模型。珠江水产研究所培育出RR-B、RW-H、BY-F三个剑尾鱼品系。其中RR-B系通过了全国水产原种和良种审定委员会第三届第一次会议的审定，是国内首个通过审定的水生实验动物品系，适用于水环境监测、水产药物安全性评价、化学品毒性检测、动物疾病检验模型及遗传生物学研究等领域的水生实验动物。
红鲫为鲫鱼的变种，主要分布在江南一带，其食用、观赏价值很高。由于红鲫作为实验动物具有生活力强、性成熟早、繁殖率强、体型适当、杂食性等特点，湖南南华大学实验动物学部已将红鲫鱼实验动物化，采用雌雄核发育技术建立了红鲫鱼近交系，主要用于遗传育各种、受精生物学、肿瘤学、毒理学等科学研究。
