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曹红艳


曹红艳

卫生统计学博士,副教授,硕士生指导教师

E-mail:caohy@sxmu.edu.cn

教育经历

2019.11-2021.11,美国密歇根州立大学,概率与统计系,博士后

2014.4-2015.4,美国密歇根州立大学,概率与统计系,访问学者

2013.9-2017.7,山西医科大学,流行病与卫生统计学,博士

2006.9-2009.7,山西医科大学,流行病与卫生统计学,硕士

2000.9-2004.7,山西大学,信息与计算科学专业,学士

工作经历

2017.12-至今,山西医科大学,副教授

2009.8-2017.11,山西医科大学,讲师

2004.7-2009.7,山西医科大学,助教

学术

全国工业统计学教学研究会健康医疗大数据学会理事,《中国医院统计》杂志编委,山西省医学会临床流行病学和循证医学专业委员会委员

研究方向

统计遗传与基因组学,多组学数据整合方法及应用,单细胞组学数据统计建模方法及应用

主持科研项目

1.国家自然科学基金委员会,青年基金,71403156,基于潜在结构分析的出生缺陷人群分布特征和干预策略研究,2015-01至2017-12,19万元,已结题,主持

2.山西省科技厅,自然科学研究面上项目, 202303021211130,基于无监督核融合的多组学数据整合肿瘤分子分型方法研究, 2024-01至2026-12, 8万元,在研,主持

3.山西省科技厅,自然科学基金,201901D111204,冠心病多系统数据整合分的精准预后模型构建,2019-09至2022-09,5万元,已结题,主持

4.山西省回国留学人员科研资助项目,2017-054,基于惩罚回归的纵向数据基因关联分析2017-07月-2020-07,2万元,已结题,主持

教学改革项目

1.山西省高等学校一般性教学改革创新立项项目,线上线下混合课程的潜在结构学情分析,J20230477,2023.8-2025.8,主持。

出版教材

1.医学统计学,中国协和医科大学出版社, 2018, 978-7-5679-1038-6,参编

2.医药数理统计,科学出版社, 2018, 978-7-03-052786-8,参编

软著

1.基于网络增强相似网络融合的多组学数据整合分型软件V1.0,2023

2.基于iCluster系列方法的多组学数据聚类分析管理软件V1.0,2020

获奖情况

山西省“三晋英才”支持计划青年优秀人才,全国大学生统计建模大赛山西赛区选拔赛研究生组二等奖(指导教师),“华为杯”第十七届中国研究生数学建模竞赛三等奖(指导教师)。

部分发表论文

1.Hongyan Cao, Congcong Jia, Zhi Li, Haitao Yang, Ruiling Fang, Yanbo Zhang, Yuehua Cui*, wMKL: multi-omics data integration enables novel cancer subtype identification via weight-boosted multi-kernel learning,British Journal of Cancer, 2024.

2.Yifang Wei, Lingmei Li, Xin Zhao, Haitao Yang, Jian Sa,Hongyan Cao*, Yuehua Cui*. Cancer subtyping with heterogeneous multi-omics data via hierarchical multi-kernel learning.Briefings in Bioinformatics, 2023, 24(1), bbac488.

3.Jiaying Wang, Yuting Miao, Lingmei Li, Yongqing Wu, Yan Ren*, Yuehua Cui*,Hongyan Cao*, Multi-omics data integration for hepatocellular carcinoma subtyping with multikernel learning.Frontiers in Genetics, 2022, 13:962870.

4.Lingmei Li, Yifang Wei, Guojing Shi, Haitao Yang, Zhi Li, Ruiling Fang,Hongyan Cao*, Yuehua Cui*. Multi-omics data integration for subtype identification of Chinese lower-grade gliomas: a joint similarity network fusion approach.Computational and Structural Biotechnology Journal, 2022,20: 3482-3492.

5.Yongqing Wu, Huihui Wang, Zhi Li, Jinfang Cheng, Ruiling Fang,Hongyan Cao*, Yuehua Cui*. Subtypes Identification on Heart Failure with Preserved Ejection Fraction via Network Enhancement Fusion using Multi-omics Data[J].Computational and Structural Biotechnology Journal, 2021, 19: 1567-1578.

6.Liye Zhou, Zhifei Guo, Bijue Wang, Yongqing Wu, Zhi Li, Hongmei Yao, Ruiling Fang, Haitao Yang,Hongyan Cao*, Yuehua Cui*.Risk Prediction in Patients With Heart Failure With Preserved Ejection Fraction Using Gene Expression Data and Machine Learning[J].Frontiers in genetics, 2021, 12: 652315.

7.Huihui Wang, Yongqing Wu, Ruiling Fang, Jian Sa, Zhi Li,HongyanCao*, Yuehua Cui*.Time-Varying Gene Network Analysis of Human Prefrontal Cortex Development[J].Frontiers in Genetics, 2020,11: 574543.

8.Hongyan Cao, Zhi Li, Haitao Yang, Yuehua Cui*, Yanbo Zhang*. Longitudinal data analysis for rare variants detection with penalized quadratic inference function[J].Scientific Reports, 2017, 7(1):650.

9.Hongyan Cao, Xiaoyuan Wei, Xingping Guo, Chunying Song, Yanhong Luo, Yuehua Cui, Xianming Hu, Yanbo Zhang*. Screening high-risk clusters for developing birth defects in mothers in Shanxi Province[J].BMC Pregnancy and Childbirth, 2015,15:343.

10.赵鑫,魏亿芳,李灵梅,师国京,房瑞玲,曹红艳*.基于MOVICS集成聚类的低级别胶质瘤多组学数据整合分子分型[J].中华疾病控制杂志,2023, 27(2):216-223.

11.李灵梅,魏亿芳,李治,房瑞玲,崔跃华*,曹红艳*.基于rMKL-LPP方法的乳头状肾细胞癌多组学数据整合分型分析.中国卫生统计,2022, 39(4): 522-528.北大中文核心期刊,第一标注.

12.魏亿芳,李灵梅,李治,房瑞玲,曹红艳*,崔跃华*.基于多组学数据的透明细胞肾细胞癌预后分子分型研究[J].中华疾病控制杂志, 2022, 26(3): 315-324.

13.武永清,郭志飞,房瑞玲,李治,曹红艳*,崔跃华*.基于相似核融合的多组学数据结直肠癌分子亚型研究[J].中国卫生统计, 2021, 38(5):650-655,660.

14.王碧珏,郭志飞,杨海涛,李治,王菊平,曹红艳*,周立业*.基于因果推断方法检验mRNA在年龄和低级别胶质瘤中的中介效应[J].中国卫生统计,2020,37(6):840-843,847.

15.郭志飞,王碧珏,杨海涛,李治,王菊平,曹红艳*,周立业*.基于加权随机森林的三阴性乳腺癌microRNA组学数据的分类预测[J].中国卫生统计, 2020, 37(6):809-812,817.

16.王慧慧,萨建,曹红艳*,崔跃华*.基于时间序列的急性髓系白血病融合基因表达网络差异分析[J].中华疾病控制杂志, 2020,24(3):275-278,289.

17.曹红艳,曾平,李治,崔跃华,张岩波*.惩罚广义估计方程在纵向数据基因关联分析中的应用[J].中国卫生统计, 2017, 34(4): 534-537.

18.曹红艳,罗艳虹,张岩波*.卫生统计学贯通式教学方法的应用[J].中国卫生统计, 2017, 34(2): 355-357.

19.曹红艳,马靖,李治,张岩波*.基于隐马尔可夫模型对原核生物编码序列的识别[J].中国卫生统计, 2015, 32(2):254-256.

20.范宇晖,王孟卓,樊宁宁,曹红艳*,郭东星*.脑卒中发病与环境因素的相关性分析[J].数理医药学杂志, 2013, 26(6): 692-695.