山西医科大学公共卫生学院前身为山西医学院卫生系。早在1951年，时为山西大学医学院成立公共卫生学科。1953年，山西医学院独立建校，成立卫生系。1955年，卫生部和高等教育部决定，将江苏医学院、山东医学院、浙江医学院等3所院校的卫生系调整到山西医学院，与山西医学院卫生系合并组建，成为当时全国高校保留的六所卫生系之一。1996年，更名为山西医科大学公共卫生学院。学院入选国家高水平公共卫生学院建设名单。
学院为推进“大公卫、大健康”学科发展，组建了雄厚的师资队伍。其中，专任教师220名，高级职称163人，博士学位教师199人，有国家级人才4名，省级教学名师15名，“三晋英才”等省级人才78名。博士生导师80名，硕士生导师83名，目前，学院在校本科生1090人，硕士研究生640人，博士研究生53人，已形成“以预防医学为主，相关专业协调发展的多专业、多层次人才培养体系”。
    学院现有预防医学与卫生检验与检疫学两个专业，有劳动卫生学、环境卫生学、儿少卫生学、营养与食品卫生学、卫生毒理学、卫生检验学、卫生统计学、社会医学、流行病学9个教研室和1个教学实验中心，有预防医学研究所与营养食品科学研究所2个研究所。 2004年，预防医学专业被山西省教育厅评为“山西省品牌专业”，2008年被教育部、财政部评为“国家特色专业”，2016年被评为“山西省高等学校优势建设专业”，2019年被批准为教育部“国家级一流本科专业”建设点和“山西省一流本科专业”建设点。2020年卫生检验与检疫专业被批准为“山西省一流本科专业”建设点，2021年被批准为教育部“国家级一流本科专业”建设点。学院现有1门国家级一流课程，1门省级一流课程，9门校级一流课程；2门省级精品资源共享课程，3门省级精品课程，4门校级精品课程，8门校级优秀课程。学院有 3 个研究生培养基地和33个本科生实践教学基地。流行病与卫生统计学为山西省研究生教学精品课程。流行病与卫生统计学、劳动与环境卫生学为山西省研究生教育优秀导师团队。
     1981年，学院劳动卫生学、环境卫生学、儿童少年卫生学和营养学成为国家首批硕士学位授权学科。2000年，流行病与卫生统计学学科获得国家博士学位授予权。2001年，学院成为国家首批公共卫生硕士学位（MPH）试点单位。2007年，学院获批建立公共卫生与预防医学博士后科研流动站。2011年，学院公共卫生与预防医学一级学科获得博士学位授予权。2016年，学院劳动与环境卫生学通过山西省重点学科评估；流行病与卫生统计学由山西省重点建设学科提升为山西省重点学科；儿少卫生与妇幼保健卫生学通过山西省重点建设学科评估。2018年，学院公共卫生与预防医学一级学科被评为山西省重点学科。
学院下设山西医科大学预防医学研究所和营养食品科学研究所2个研究所，为中国诱变剂学会环境与神经退行性疾病专业委员会、山西省营养学会、山西省环境诱变剂学会挂靠单位，为中国营养学会注册营养师课程教学基地。
    2016年，学院成立环境健康损害山西省重点实验室；2018年，学院成立重大疾病风险评估山西省重点实验室。2018年，学院与山西省疾病预防控制中心协作创建山西医科大学预防医学科学院。2020年，学院成为重大传染性疾病防控诊治山西省重点实验室成员单位。2020年，学院成立山西医科大学“反向病原学”协同创新中心，由中国工程院徐建国院士担任中心学术委员会主任。2022年，学院获批山西医科大学黄河流域生态公共卫生安全研究中心。2023年获批煤炭环境致病与防治教育部重点实验室。
    70多年来，山西医科大学公共卫生学院不断发展壮大，已形成“以预防医学为主，相关专业协调发展的多专业、多层次人才培养体系”。学院秉承“厚德博学、协作创新”院训，对标一流，凝心聚力，为建设国家高水平公共卫生学院而努力奋斗。