山西医科大学基础医学实验教学中心组建于2010年，是由原属基础医学院的形态学实验室、机能学实验室、生物化学与分子生物学实验室、人体解剖学实验室、医用物理学实验室、医用化学实验室、微生物与免疫学实验室、生物制药实验室8个教学实验室以及生命科学馆整合而成，它是为实现适应当前医学教育推进课程整合、鼓励实验教学独立运转、开展综合设计实验和大学生创新实验的趋势和要求而建的。中心建成后具备了接纳学校各专业在基础医学教育阶段满足医学和生物学不同学科的实践教学，指导大学生自主创新创业研究，面向学校乃至社会广泛开展生命健康教育的能力。2013年中心被评为山西省实验教学示范中心，2016年1月被教育部高等教育司评为国家级实验教学示范中心，规范名称为“基础医学国家级实验教学示范中心（山西医科大学）”，同年8月成为山西省科普基地。中心对山西省医学教育发挥着引领作用，并承担着应尽的社会职能。

    实验教学中心成立以来，学校投入了大量资金进行设备购置和实验室改造，明显改善了实验教学环境。在教学中，中心结合学科发展和我国教育改革的要求，不断探索并取得了良好的效果。按照高等医学教育的改革趋势和发展方向，以创新性的结构模式，和其他高校合作共建“以器官为中心”虚拟仿真教学系统，建设综合性的虚拟仿真实验教学资源库，尝试和探索全新的医学课程教改体系。为实现实验室资源有效整合，构建功能集约、资源优化、开放充分的实验教学平台，不仅如此，中心在课程设置、学生培养等方面更新了教学理念，进行了大胆的改革和探索，取得了显著的成效。同时，中心不断完善人员管理体系，健全各类规章制度，鼓励教学研究改革，充分开放共享资源，起到了良好的辐射和示范作用。